1- وضع وتنفيذ خطة وبرنامج عمل المراكز والإشراف على تنفيذها.

2- وضع وتنفيذ الخطط والبرامج والمناهج الكفيلة بتطوير مراكز التحفيظ ورفع مستوى أدائها من الناحية الفنية والتربوية.

3- وضع وتنفيذ الأنظمة واللوائح والإجراءات الخاصة بتشغيل المراكز والحلقات وتطبيق ما يعتمد منها.

4- متابعة عمل جميع المراكز والحلقات إدارياً ومالياً وفنياً.

5- وضع معايير الأداء وتقييم أداء المراكز والحلقات القرآنية والمنتسبين لها وفقاً لذلك.

6- تنظيم مسابقة البحرين الكبرى لحفظ القرآن الكريم وتجويده وتفسيره، وتطويرها بشكل مستمر.

7- تمثيل مملكة البحرين في مسابقات القرآن الكريم الدولية والسعي لتحقيق مراكز متقدمة فيها.

8- المشاركة في المنتديات والتجمعات المعنية بالقرآن الكريم داخل البحرين وخارجها.

9-تخطيط وتنفيذ البرامج والأنشطة لتعزيز العلاقة الإيجابية بين مراكز التحفيظ وأفراد ومؤسسات المجتمع.

10-مراجعة المصاحف والكتب المتعلقة بالقرآن الكريم بالتنسيق مع لجنة مراجعة المصاحف.​​